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森林による二酸化炭素吸収分を、削減割当量に組み入れるよう要求した日・米・加の主張に対して、欧州諸国や発展途上国が強く反対したからである。日本などの主張が的をはずれていることは誰が見ても明らかである。

なぜなら、極相河川水流出に対して仮にエスチュアリー循環が線形に応答する場合．純一次生産量(億トン/年）面積(106/km2）水域合計ものではないことを示唆している。もし、ダムや河口堰の建設を行うことで、流量が半分になると、連行加入量も半分になるので、合計の栄養塩負荷は現状の半分になってしまう。
つまり、河川水流量が減ると、エスチュアリー循環による、沖合い下層からの負荷が同時に減るため、海域の生産性は大きく低下することが予想されるのである。そのうえ、ダム湖は水の滞留時間を長くし、ダム湖内での植物プランクトンの増殖を促し、本来ならば、エスチュアリーに流出するはずだった栄養塩をトラップしてしまうので、エスチュアリーの一次生産は、実際にはさらに低下すると考えられる。
その例として、河川水流量を半分に、栄養塩濃度を半分にすると、河川水による負荷は○・二五となり、連行加現状濃度×0.5流量×0.5、濃度×２流量×０５流量×0.5、濃度×0.5入量○・五との合計で○・七五まで低下する。ドナウ川に建設された水門により、ケイ素が多く取り除かれたため、その下流にある黒海の植物プランクトン種が、ケイ藻から渦鞭毛藻に変化したことが報告されている。
通常、ケイ藻は、動物プランクトンなどに餌としてよく利用されるが、渦鞭毛藻の中には有害・有毒種も少なくなく、これらは動物プランクトンに食べられないので、悪質な赤潮被害を生じる。つまり、栄養塩負荷の量的・質的変化は、植物プランクトンの群集構造の変化を通して、生態系全体の構造を変化させる危険性をはらんでいる。
沿岸海洋生態系の管理・保全の大型動物を養い、われわれは漁獲という形で恩恵をこうむっている。埋め立てや渡喋は、これらの底生生物を直接死に至らしめるとともに、生息場所をも奪う行為であり、生態系に重大なダメージを与えるものである。
瀬戸内海の海砂採取では、天然記念物であるナメクジウオや、タイの餌となるイカナゴの生息が問題視された。そのような一部の種の生存の場を確保することが、ひいては生態系全体を守ることにつながるのであればよいが、生態系は多くの生物が共存してこそ「系」であるので、一面のみをとらえて沿岸開発の善し悪しを評価すべきではない。
埋め立てや波喋による海岸・海底地形の変化が、潮汐の振幅や位相を変化させることが、最近わかってきた。先に述べたように、潮汐による鉛直混合は、沿岸海域の物質循環速度に大きくかかわっており、生態系の構造を決める重要な要因である。
たとえば、植物プランクトンは、混合強度が強いとケイ藻が繁茂し、弱いと鞭毛藻が優占することが知られている。卵から聯化したばかりの稚貝は、浮遊幼生期を経て着底する。
その際に潮汐混合の強さは大きく関係している。ここ述べたことは、最近の知見を集めたものである。

沿岸海域は、浅いことが災いして、埋め立てや波喋の恰好の対象となってきた。それは平野部が少ないことから、工場、農業用地、住宅地を確保するためであったり、コンクリートを作るのに必要となる海砂を採るためであったりした。
しかしながら、これまで述べてきたように、沿岸海域は浄化作用としての脱窒が盛んであり、底生微小藻類の生産はカレイ、ヒラメ、貝類、エビ、カニなどの事例や理論が示しているところであるが、そのような複雑な生態系の構造と機能を明らかにすることで、確固とした科学的知見に基づいた環境の管理・保全が望まれる。とはいえ、十分とはいえない。
海洋生態学の観点から、沿岸海域の管理・保全に向けて、定量的な評価を加えるべき研究課題はまだ多く残されている。生態系内での「食うー食われる」の関係や、「種間競合」や「共存」の問題が簡単なものではないことは、いくつかの現場実験である。
エル・ニーニョは、大気の数年スケールの変動である南方振動と密接な関係があることから、エル・ニーニョつまり実際の気候変動は、自律的な気象の変動周期に、人為的な影響による長期変化傾向（トレンド）が組み合わさったものといえよう。気候変動にともなう風や気温の変化は、海洋の成層状態や流れに大きな影響を与える。
さらにこれらの海洋環境変化は、植物プランクトンに対する栄養塩の供給プロセスや、プランクトン・魚類の分布などに変化を及ぼし、一次生産量や生物の分布パターンを変化させる。したがって、気候変動が海洋生態系を変化させるメカニズムを明らかにするためには、個々の特異的な気候変動に基づく、特定の生態系の応答を明らかにする必要がある。
したがって、ここでは数年から数十年周期でおこる気候変動、および長期の温暖化傾向が、海洋の植物・動物プランクトンおよび魚類に対して、どのようなプロセスで影響を与えるのかを明らかにする。エル・ニーニョ気候変動といえば、まず思い浮かぶのは、温暖化といった人為的な原因に基づく地球環境変化であろう。
実際、産業活動によって排出される温暖化ガスの影響は、現在もっとも関心を集めている環境問題であり、今後排出量が減少しないかぎり、気候へ影響を与えつづけると考えられる。しかし、気候は人為的な影響を受けて変動しているだけでなく、それ自身がもつ固有の周期でも変動している。
たとえば、大気と海洋の相互作用で発生するエル・ニーニョ／南方振動（エンソ）は、三から七年の周期で発生している。また、発生のメカニズムはまだよくわかっていないものの、アリューシャン低気圧の勢力も十から数十年の周期で変動している。
エル・ニーニョと南方振動の頭文字をつないで、エンソともよばれている。通常、太平洋赤道域では、太陽に暖められた表層の海水が、貿易風とよばれる東風によって、インドネシア側に集められ、太平洋の反対側のペルー沖では、下層の海水が表層へ湧きあがる「湧昇」がおこっている。

しかし、なんらかの原因で貿易風が弱まると、西側にたまっていた暖かい海水が東側へ移動し、ペルー沖の水温が平年よりも高くなってしまう。さらに、東部赤道域の広い範囲にわたって、表面水温が上昇することにより、西から東へ熱を運ぶ「ウオーカー循環」とよばれる大気循環が弱まり、その影響で貿易風はさらに弱くなるために、東部赤道域の水温はますます上昇してしまう。
これがエル・ニーニョ現象である。ペルー沖では通常、「湧昇」により下層から表層生態系へ、大量の栄養塩類が供給されることによって、高い一次生産量が維持されている。
しかしエル・ニーニョが発生すると湧昇が衰退してしまうため、栄養塩の供給量が減る。そして一次生産量は、通常の三分の一以下にまで減少してしまい、さらに植物プランクトンを餌としている動物プランクトンも激減してしまう。
湧昇は、低温水を供給することによって、表層を冷却する役割もはたしている。そのためペルー沖の表層は比較的低い温度に保たれており、赤道直下にもかかわらず、亜熱帯性の植物・動物プランクトン種が卓越している。

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